MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 chromosome

Total Repeats: 22386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010382	TTA	2	6	76	81	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010382	TGT	2	6	86	91	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010382	A	7	7	94	100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010382	TAA	2	6	660	665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010382	CCT	2	6	677	682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010382	TGC	2	6	864	869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010382	CTA	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010382	TCTA	2	8	1243	1250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010382	T	6	6	1321	1326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010382	TA	3	6	1331	1336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010382	AATA	2	8	1337	1344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010382	T	6	6	2547	2552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010382	AG	3	6	2579	2584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010382	AC	3	6	2610	2615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010382	T	6	6	3970	3975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010382	TTCA	2	8	4015	4022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010382	AC	3	6	4026	4031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010382	ATG	2	6	4033	4038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010382	GAG	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010382	GAC	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010382	T	6	6	8517	8522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010382	AAT	2	6	8529	8534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010382	ATT	2	6	8547	8552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010382	ATAAA	2	10	8565	8574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010382	TCAT	2	8	9734	9741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010382	ATA	2	6	9749	9754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010382	AAGAG	2	10	9755	9764	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010382	GTAAA	2	10	9777	9786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010382	AATAT	2	10	9820	9829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010382	ATA	2	6	9889	9894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010382	ACA	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010382	TAGC	2	8	10012	10019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010382	CTAG	2	8	10020	10027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010382	ATG	2	6	10056	10061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010382	GGC	2	6	10131	10136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010382	GCG	2	6	10193	10198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010382	ACCT	2	8	10222	10229	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010382	AAT	2	6	10270	10275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010382	ATT	2	6	10295	10300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010382	CGA	2	6	10378	10383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010382	GCA	2	6	10452	10457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010382	CGC	2	6	10499	10504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010382	GTGA	2	8	10505	10512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010382	TGT	2	6	10538	10543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010382	GAA	2	6	10548	10553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010382	AGT	2	6	10561	10566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010382	TTA	2	6	10591	10596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010382	CAG	2	6	10620	10625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010382	ATT	2	6	10661	10666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010382	GC	4	8	10676	10683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010382	GGT	2	6	10685	10690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010382	AGA	2	6	10761	10766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010382	GGA	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010382	TGC	2	6	10956	10961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010382	GAA	2	6	11075	11080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010382	GGT	2	6	11148	11153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010382	GTC	2	6	11163	11168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010382	TCGTG	2	10	11172	11181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010382	CAT	2	6	11230	11235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010382	GGA	2	6	11274	11279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010382	ATC	2	6	11298	11303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010382	AC	3	6	11325	11330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010382	AC	3	6	11494	11499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010382	CGTC	2	8	11500	11507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010382	AGCC	2	8	11556	11563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010382	GAT	2	6	11579	11584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010382	CCT	2	6	11635	11640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010382	TTA	2	6	11710	11715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010382	AT	3	6	11812	11817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010382	GCCT	2	8	11850	11857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010382	AGG	2	6	11865	11870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010382	CCA	2	6	11895	11900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010382	AACA	2	8	11943	11950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010382	ATTT	2	8	11952	11959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010382	T	6	6	11957	11962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010382	T	8	8	11966	11973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010382	TAA	2	6	11981	11986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010382	GAA	2	6	12162	12167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010382	GTA	2	6	12259	12264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010382	GGA	2	6	12327	12332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010382	AGAA	2	8	12335	12342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010382	GCG	2	6	12361	12366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010382	G	6	6	12406	12411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010382	GTTC	2	8	12506	12513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010382	TC	3	6	12512	12517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010382	CGG	2	6	12536	12541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010382	GGA	2	6	12568	12573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010382	TAC	2	6	12592	12597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010382	AGT	2	6	12689	12694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010382	AAGGT	2	10	12867	12876	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010382	CACG	2	8	12900	12907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010382	TC	3	6	12976	12981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010382	TGA	2	6	13007	13012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010382	ACC	2	6	13154	13159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010382	AGC	2	6	13234	13239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010382	CAT	2	6	13240	13245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010382	TGG	2	6	13393	13398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010382	TAGGCG	2	12	13527	13538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010382	ACA	2	6	13543	13548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010382	ACC	2	6	13564	13569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010382	G	6	6	13589	13594	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010382	GC	3	6	13614	13619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010382	GT	4	8	13650	13657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010382	GAG	2	6	13790	13795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010382	GA	3	6	13813	13818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010382	CGG	2	6	14049	14054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010382	GA	3	6	14147	14152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010382	TAGG	2	8	14265	14272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010382	AGG	2	6	14302	14307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010382	TAC	2	6	14319	14324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010382	CCT	2	6	14407	14412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010382	GGT	2	6	14543	14548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010382	CGT	2	6	14738	14743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010382	CGT	2	6	14764	14769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010382	GAG	2	6	14787	14792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010382	AC	3	6	14822	14827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010382	TG	3	6	14873	14878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010382	C	6	6	14914	14919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_010382	AAGT	2	8	14944	14951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010382	GTG	2	6	14997	15002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010382	ATCG	2	8	15026	15033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010382	AAT	2	6	15090	15095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010382	AGT	2	6	15123	15128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010382	GA	3	6	15140	15145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010382	TGAC	2	8	15169	15176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010382	GAA	2	6	15195	15200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010382	TGA	2	6	15235	15240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010382	CAA	2	6	15345	15350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010382	TG	3	6	15362	15367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010382	T	7	7	15375	15381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010382	AAATT	2	10	15419	15428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010382	TA	3	6	15434	15439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010382	CTAT	2	8	15466	15473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010382	TAT	2	6	15481	15486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010382	AAT	2	6	15503	15508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010382	ATC	2	6	15562	15567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010382	TAA	2	6	16521	16526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010382	TAA	3	9	16538	16546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010382	TTA	2	6	16552	16557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010382	TA	3	6	16556	16561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010382	CTA	2	6	16585	16590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010382	ATAAAA	2	12	16595	16606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010382	ACAA	2	8	16617	16624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010382	TTA	2	6	16636	16641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010382	TA	3	6	16640	16645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010382	TAGC	2	8	16729	16736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010382	CTAG	2	8	16737	16744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010382	ATG	2	6	16773	16778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010382	GGC	2	6	16848	16853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010382	GCG	2	6	16910	16915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_010382	AAT	2	6	16987	16992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_010382	ATT	2	6	17378	17383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_010382	GGT	2	6	17868	17873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_010382	GGA	2	6	17994	17999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_010382	ATAA	2	8	33046	33053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010382	ATG	2	6	34405	34410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_010382	A	6	6	34776	34781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_010382	G	6	6	52729	52734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_010382	GAG	2	6	52930	52935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
438	NC_010382	GA	3	6	52953	52958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
439	NC_010382	CGG	2	6	53189	53194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_010382	GA	3	6	53287	53292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
441	NC_010382	TAGG	2	8	53405	53412	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
442	NC_010382	AGG	2	6	53442	53447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_010382	TAC	2	6	53459	53464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_010382	CCT	2	6	53547	53552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_010382	GGT	2	6	53684	53689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_010382	CGT	2	6	53905	53910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_010382	GAG	2	6	53928	53933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_010382	AAGT	2	8	54085	54092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_010382	GTG	2	6	54138	54143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
454	NC_010382	ATCG	2	8	54167	54174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
455	NC_010382	AAT	2	6	54231	54236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_010382	GAA	2	6	54339	54344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_010382	TGA	2	6	54379	54384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_010382	AT	3	6	54506	54511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_010382	CGG	2	6	54514	54519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_010382	TGTC	2	8	54530	54537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_010382	G	6	6	54585	54590	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_010382	GA	3	6	55164	55169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
469	NC_010382	T	6	6	55174	55179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_010382	ATT	2	6	57353	57358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_010382	ATT	2	6	57373	57378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_010382	AAT	2	6	57421	57426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_010382	AGC	2	6	57507	57512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
474	NC_010382	AGG	2	6	57569	57574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
475	NC_010382	ACG	2	6	57594	57599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_010382	CT	3	6	57620	57625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
477	NC_010382	ATT	2	6	57645	57650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_010382	CCT	2	6	57809	57814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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481	NC_010382	AT	3	6	58080	58085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_010382	CTAG	2	8	58130	58137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
483	NC_010382	T	6	6	58405	58410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_010382	AGT	2	6	58429	58434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
485	NC_010382	TCAT	2	8	58479	58486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_010382	GAG	2	6	58542	58547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
487	NC_010382	AAT	2	6	58580	58585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_010382	ACT	2	6	58588	58593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_010382	AGGA	2	8	58650	58657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
490	NC_010382	GGT	2	6	60887	60892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
491	NC_010382	TCTTT	2	10	60898	60907	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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495	NC_010382	ATA	2	6	62923	62928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_010382	TA	3	6	62927	62932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_010382	GT	3	6	62973	62978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_010382	ATT	2	6	63318	63323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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